Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNGAP1Q96PV0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNGAP1Q96PV0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms