Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRERF1Q96PN7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms