Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RDH12Q96NR8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RDH12Q96NR8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms