Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT74Q96LB3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms