Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM2Q96JY6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM2Q96JY6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms