Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A4AQ96JQ5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A4AQ96JQ5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms