Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TPD52L3Q96J77 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms