Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC3Q96F86 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms