Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN23Q96B33 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN23Q96B33 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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