Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPS3Q969F9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS3Q969F9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms