Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED12Q93074 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED12Q93074 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED12Q93074 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED12Q93074 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED12Q93074 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MED12Q93074 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED12Q93074 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED12Q93074 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED12Q93074 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED12Q93074 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED12Q93074 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED12Q93074 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED12Q93074 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED12Q93074 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED12Q93074 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED12Q93074 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED12Q93074 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MED12Q93074 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MED12Q93074 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED12Q93074 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MED12Q93074 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms