Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P3H4Q92791 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P3H4Q92791 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
P3H4Q92791 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P3H4Q92791 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
P3H4Q92791 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P3H4Q92791 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P3H4Q92791 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
P3H4Q92791 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H4Q92791 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H4Q92791 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H4Q92791 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H4Q92791 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H4Q92791 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H4Q92791 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms