Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
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PTPRUQ92729 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
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PTPRUQ92729 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRUQ92729 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
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PTPRUQ92729 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
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PTPRUQ92729 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
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PTPRUQ92729 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
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PTPRUQ92729 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
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PTPRUQ92729 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
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PTPRUQ92729 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
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PTPRUQ92729 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
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PTPRUQ92729 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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PTPRUQ92729 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRUQ92729 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
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PTPRUQ92729 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
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PTPRUQ92729 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRUQ92729 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
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