Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRIPQ8WXE1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms