Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRUNE2Q8WUY3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRUNE2Q8WUY3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms