Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE04

PANK1, Pantothenate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK1Q8TE04 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PANK1Q8TE04 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PANK1Q8TE04 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms