Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYRIPQ8NFW9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYRIPQ8NFW9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms