Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FSIP1Q8NA03 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms