Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U9

LINC00469, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00469, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00469Q8N7U9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00469Q8N7U9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00469Q8N7U9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms