Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00269Q8N2A0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms