Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYCE1Q8N0S2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYCE1Q8N0S2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms