Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPFIBP1Q86W92 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms