Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PBRM1Q86U86 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PBRM1Q86U86 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms