Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTOP3Q7RTS5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms