Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf47Q6ZRZ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms