Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCIMPQ6UWF3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms