Protein–RNA interactions for Protein: Q6UN15

FIP1L1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIP1L1Q6UN15 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FIP1L1Q6UN15 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FIP1L1Q6UN15 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms