Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CSAG1Q6PB30 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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