Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLC3Q6P597 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLC3Q6P597 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms