Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LETMD1Q6P1Q0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms