Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LDLRAD1Q5T700 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LDLRAD1Q5T700 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LDLRAD1Q5T700 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms