Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC3LQ5T215 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC3LQ5T215 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3LQ5T215 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms