Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN3Q5MJ09 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN3Q5MJ09 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms