Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFT2D3Q587I9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFT2D3Q587I9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFT2D3Q587I9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFT2D3Q587I9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFT2D3Q587I9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SFT2D3Q587I9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SFT2D3Q587I9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SFT2D3Q587I9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SFT2D3Q587I9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SFT2D3Q587I9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFT2D3Q587I9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms