Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSD17B12Q53GQ0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSD17B12Q53GQ0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms