Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTXN3Q4LDR2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN3Q4LDR2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms