Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SP6Q3SY56 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP6Q3SY56 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms