Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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