Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL40Q2TBA0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL40Q2TBA0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms