Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STX1AQ16623 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STX1AQ16623 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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