Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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