Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.813e-17■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 LGALS8-205ENST00000366583 1547 ntTSL 39.59□□□□□ -0.873e-17■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 LGALS8-216ENST00000489586 1072 ntTSL 29.22□□□□□ -0.931e-16■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 LGALS8-223ENST00000528259 1045 ntTSL 58.32□□□□□ -1.083e-17■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 LGALS8-202ENST00000323938 1855 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.183e-17■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.413e-17■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.473e-17■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.563e-17■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 LGALS8-227ENST00000532640 514 ntTSL 45.19□□□□□ -1.583e-17■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.613e-17■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.94e-11■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.714e-11■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 HAGHL-202ENST00000389701 1295 ntTSL 1 (best)21.83■■□□□ 1.094e-11■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.784e-11■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 HAGHL-215ENST00000567696 2199 ntTSL 219.28■□□□□ 0.684e-11■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.34e-11■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 HAGHL-218ENST00000569385 440 ntTSL 214.67□□□□□ -0.064e-11■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 HAGHL-210ENST00000563156 572 ntTSL 410.96□□□□□ -0.654e-11■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.464e-8■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.124e-8■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 AC022167.2-201ENST00000565934 2288 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.564e-8■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 CBX1-206ENST00000581003 812 ntTSL 311.29□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 USP36-215ENST00000589254 565 ntTSL 310.16□□□□□ -0.782e-13■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 CBX1-203ENST00000402583 578 ntTSL 48.35□□□□□ -1.074e-8■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.54e-8■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 CBX1-204ENST00000444685 544 ntTSL 54.8□□□□□ -1.644e-8■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 CRTC2-205ENST00000467860 573 ntTSL 310.48□□□□□ -0.735e-9■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 WRN-203ENST00000521620 3593 ntTSL 1 (best)3.51□□□□□ -1.852e-9■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 UNC13D-207ENST00000586930 211 ntTSL 312.69□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 AP5Z1-202ENST00000469614 2337 ntTSL 217.78■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 MAP4K4-216ENST00000491743 646 ntTSL 47.54□□□□□ -1.29e-17■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 ATP13A1-208ENST00000474955 927 ntTSL 512.66□□□□□ -0.387e-8■■■■■ 38.9
SF3B4Q15427 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.749e-11■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.719e-11■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.299e-11■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.199e-11■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.029e-11■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.029e-11■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.079e-11■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 BCL2L12-207ENST00000598979 893 ntTSL 313.41□□□□□ -0.269e-11■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.389e-11■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.419e-11■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 BCL2L12-213ENST00000619007 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.659e-11■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 FAU-208ENST00000531357 1484 nt18.19■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 FAU-204ENST00000526555 507 ntTSL 513.5□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 38.8
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SF3B4Q15427 CHTF18-217ENST00000567620 701 ntTSL 513.64□□□□□ -0.234e-10■■■■■ 38.8
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SF3B4Q15427 PCYT2-209ENST00000572157 442 ntTSL 410.35□□□□□ -0.751e-9■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 DDX5-208ENST00000578491 463 ntTSL 26.05□□□□□ -1.441e-17■■■■■ 38.8
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SF3B4Q15427 INTS10-206ENST00000520670 623 ntTSL 59.95□□□□□ -0.825e-13■■■■■ 38.8
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SF3B4Q15427 STARD7-206ENST00000495687 274 ntTSL 37.64□□□□□ -1.196e-10■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 SLC7A6-202ENST00000379152 5074 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -17e-10■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 SLC7A6-205ENST00000563080 1030 ntTSL 58.63□□□□□ -1.037e-10■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.057e-10■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.287e-10■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.327e-10■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 SLC7A6-210ENST00000566579 526 ntTSL 46.18□□□□□ -1.427e-10■■■■■ 38.8
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SF3B4Q15427 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.868e-8■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.447e-7■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.097e-7■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 CORO7-226ENST00000575531 2636 ntTSL 214.22□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 AMN-207ENST00000559789 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.42■■□□□ 1.022e-10■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 AMN-203ENST00000558590 2772 ntTSL 219.91■□□□□ 0.782e-10■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.369e-11■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 SAT1-208ENST00000487713 432 ntTSL 28.55□□□□□ -1.049e-11■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 MBTPS1-216ENST00000570064 3086 ntTSL 212.01□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 DPM1-206ENST00000494752 789 ntTSL 38.2□□□□□ -1.17e-10■■■■■ 38.8
SF3B4Q15427 ATP1B3-207ENST00000484727 657 ntTSL 25.53□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 ATP1B3-208ENST00000486782 229 ntTSL 24.09□□□□□ -1.751e-6■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 ATP1B3-209ENST00000487199 421 ntTSL 32.89□□□□□ -1.951e-6■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 NARF-221ENST00000583181 505 ntTSL 518.31■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 NARF-213ENST00000579198 599 ntTSL 514.71□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 NARF-223ENST00000584192 495 ntTSL 313.16□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 NARF-215ENST00000580748 577 ntTSL 510.34□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.443e-10■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.173e-10■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.063e-10■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 SSH3-210ENST00000532881 2587 ntTSL 1 (best)14.07□□□□□ -0.163e-10■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 SSH3-208ENST00000532181 948 ntTSL 310.97□□□□□ -0.653e-10■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 TIA1-219ENST00000496452 853 ntTSL 215.03■□□□□ -01e-11■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.69□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 RNF44-208ENST00000515051 596 ntTSL 410.98□□□□□ -0.653e-9■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 APLP2-219ENST00000533616 2041 ntTSL 216.64■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.272e-8■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.659e-11■■■■■ 38.7
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