Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BECN1Q14457 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN1Q14457 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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