Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF9Q13886 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLF9Q13886 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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