Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PMS2P11Q13670 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P11Q13670 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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