Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SF3B2Q13435 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SF3B2Q13435 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
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