Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRSQ13332 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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PTPRSQ13332 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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PTPRSQ13332 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
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PTPRSQ13332 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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PTPRSQ13332 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
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PTPRSQ13332 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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PTPRSQ13332 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRSQ13332 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRSQ13332 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRSQ13332 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRSQ13332 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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