Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
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PAPPAQ13219 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAPPAQ13219 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PAPPAQ13219 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAPPAQ13219 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAPPAQ13219 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PAPPAQ13219 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PAPPAQ13219 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PAPPAQ13219 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PAPPAQ13219 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PAPPAQ13219 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PAPPAQ13219 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PAPPAQ13219 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
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PAPPAQ13219 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAPPAQ13219 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
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PAPPAQ13219 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PAPPAQ13219 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAPPAQ13219 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
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PAPPAQ13219 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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PAPPAQ13219 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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PAPPAQ13219 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAPPAQ13219 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAPPAQ13219 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAPPAQ13219 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
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PAPPAQ13219 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAPPAQ13219 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAPPAQ13219 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
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PAPPAQ13219 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PAPPAQ13219 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
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