Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHAF1AQ13111 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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