Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STRN3Q13033 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STRN3Q13033 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRN3Q13033 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STRN3Q13033 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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